TMM 3009 Laboratoire de recherche biomédicale / Biomedical Research Laboratory (9 crédits / 9 units)

Introduction aux techniques et méthodes utilisées en recherche biomédicale. Premier module: méthodes couramment utilisées en biologie moléculaire et techniques de base pour la production, la purification et la manipulation de protéines. Troisième module: méthodes expérimentales utiles dans la recherche en métabolisme et en biologie cellulaire. Les modules 2 et 4 sont consacrés à deux projets de recherche choisis dans des domaines distincts, chacun des projets étant effectué sous la supervision d'un professeur de la Faculté de médecine et étant complété par une présentation orale et un rapport de recherche. / Introduction to the techniques and methods used in biomedical research. First module: basic techniques and methods currently used in molecular biology and protein science, including basic protein production, purification and handling. Third module: experimental methods relevant to research in metabolism and cell biology. Modules 2 and 4 are dedicated to research projects in two distinct research areas, each performed under the supervision of a professor from the Faculty of Medicine and completed by an oral presentation and a research report.

Volet / Course Component: Laboratoire / Laboratory

TMM 3101 Molecular Biology and Inherited Disorders (3 units)

Dysregulation of molecular mechanisms in inherited disease. Molecular mechanisms including gene expression, DNA replication, repair and recombination, and protein translation, with an emphasis on current methods

Course Component: Lecture

Corequisite: TMM 3009.

TMM 3102 Proteins: Structure, Functions and Diseases (3 units)

Fundamental aspects of protein structure and function, with an emphasis on the structural changes of proteins involved in some human diseases and with examples highlighting the biochemical impact of disease related mutations at structural and kinetic levels. Review of modern techniques used to study the structure of proteins.

Course Component: Lecture

Corequisite: TMM 3009.

TMM 3103 Metabolic Pathways of Human Diseases (3 units)

Metabolic regulation and dysregulation in some human diseases. Regulation of lipid metabolism and hyperlipidemia in the peripheral and central nervous systems; glucose and carbohydrate metabolism in diabetes, pathological one-carbon metabolism in cancer and response to chemotherapy; inherited diseases of metabolism (e.g. PKU, mitochondrial disorders) and how the microbiome interacts with whole-body metabolism

Course Component: Lecture

Corequisite: TMM 3009.

TMM 3104 Cellular Basis of Disease (3 units)

Fundamental aspects of cell biology, with an emphasis on signaling pathways as related to prevalent human diseases, in the context of fundamental cellular processes and model organisms. Cell and tissue architecture and motility, epigenetics, membrane structure and dynamics, endocytosis and intracellular trafficking, cell cycle, formation and function of cell organelles, receptor and oncogene-mediated signaling and stem cells

Course Component: Lecture

Corequisite: TMM 3009.

TMM 3105 Immunity and Infectious Diseases (3 units)

Disease-oriented basis to immune defenses, encompassing functional contributions of cell components, cytokines and other immune mediators to health and disease.

Course Component: Lecture

Corequisite: TMM 3104.

TMM 3106 Introduction to Neurobiology (3 units)

Fundamentals of the nervous system from the microscopic (cells and molecules) to the macroscopic (systems and behaviour) levels. Major topics in cellular and molecular neurobiology, including ion channels and receptors, synaptic transmission, neurodevelopment, and neural plasticity.

Course Component: Lecture

Corequisite: TMM 3009.

TMM 3107 Statistical and Computational Methods for Molecular Medicine and Genomics (3 units)

Sequence analysis methods and statistical methods currently used to analyze the plethora of data related to molecular medicine and genomics, including methods for genome analysis, analysis of gene regulation mechanisms, statistical analysis of preprocessed gene expression and protein/metabolite abundance data.

Course Component: Lecture

Prerequisite or corequisite: TMM 3009.

TMM 3300 Selected Topics in Translational and Molecular Medicine (3 units)

Selected topics in translational and molecular medicine.

Course Component: Lecture

Corequisite: TMM 3009.

TMM 3501 Biologie moléculaire et maladies héréditaires (3 crédits)

Dysrégulation des mécanismes moléculaires dans les maladies héréditaires. Mécanismes moléculaires incluant l'expression des gènes, la réplication, la réparation et la recombinaison de l'ADN, ainsi que la traduction des ARNm en protéines, avec une emphase sur les méthodes modernes d'analyse. Méthodes d'enseignement: surtout des cours magistraux complétés par des séances hebdomadaires d'apprentissage par groupe.

Volet : Cours magistral

Concomitant: TMM 3009.

TMM 3502 Les protéines : Structure, fonctions et maladies (3 crédits)

Aspects fondamentaux de la structure et de la fonction des protéines, avec une emphase sur les changements structuraux des protéines impliqués dans certaines maladies chez l'humain et des exemples d'analyses détaillées des impacts biochimiques, aussi bien structuraux que cinétiques, de mutations associées aux maladies. Revue des techniques utilisées pour l'étude structurale des protéines.

Volet : Cours magistral

Concomitant: TMM 3009.

TMM 3503 Voies métaboliques des maladies chez l'humain (3 crédits)

Bases de la régulation métabolique et des dysrégulations impliquées dans certaines maladies chez l'humain. Régulation du métabolisme des lipides et hyperlipidémie dans les systèmes nerveux central et périphérique, métabolisme du glucose et des glucides dans le diabète, métabolisme monocarboné pathologique dans le cancer et réponse à la chimiothérapie, maladies héréditaires du métabolisme (e.g. PCU et maladies mitochondriales) et interactions entre le microbiome et le métabolisme de l'organisme.

Volet : Cours magistral

Concomitant: TMM 3009.

TMM 3504 Bases cellulaires de la maladie (3 crédits)

Aspects fondamentaux de la biologie cellulaire, avec une emphase sur les voies de signalisation reliées aux maladies humaines prévalentes, qui seront explorées à partir des processus cellulaires fondamentaux jusqu'aux organismes modèles. Motilité et architecture des cellules et tissus, épigénétique, structure et dynamique des membranes, endocytose et trafic intracellulaire, cycle cellulaire, formation et fonction des organelles cellulaires, signalisation via oncogènes et récepteurs, et cellules souches.

Volet : Cours magistral

Concomitant: TMM 3009.

TMM 3505 Immunité et maladies infectieuses (3 crédits)

Bases de la défense immunitaire, comprenant les contributions fonctionnelles des composantes cellulaires, cytokines et autres médiateurs immunitaires à la santé et à la maladie.

Volet : Cours magistral

Concomitant: TMM 3504.

TMM 3506 Introduction à la neurobiologie (3 crédits)

Fondements du système nerveux aux niveaux microscopique (cellules et molécules) et macroscopique (systèmes et comportement). Sujets principaux de la neurobiologie cellulaire et moléculaire, incluant les canaux ioniques et récepteurs, la transmission synaptique, le neurodéveloppement et la plasticité neuronale.

Volet : Cours magistral

Concomitant: TMM 3009.

TMM 3700 Sujets choisis en médecine moléculaire et translationnelle (3 crédits)

Sujets choisis en médecine moléculaire et translationnelle.

Volet : Cours magistral

Concomitant: TMM 3009.

TMM 4012 Projet de recherche / Honours (12 crédits / 12 units)

Projet de recherche sous la supervision d'un professeur de la Faculté de médecine. À la fin de l'année académique, l'étudiant soumettra un rapport de recherché détaillé. / Research project under the supervision of a professor from the Faculty of Medicine. At the end of the academic year, the student will submit a detailed research report.

Volet / Course Component: Laboratoire / Laboratory

Prerequisite: TMM 3009.

TMM 4101 Introduction to Cancer Biology (3 units)

Major topics in cancer biology including tumor suppression/oncogenes; apoptosis in cancer; cell immortalization and senescence; genomic instability; multistep tumorigenesis/inflammation in cancer; biology of angiogenesis; rational therapies.

Course Component: Lecture

Prerequisites: CMM 5001 or (PHS 3341, PHS 3342).

TMM 4102 Regenerative Medicine (3 units)

Current and advanced topics in regenerative medicine including stem cells, the regulation of their fates (renewal, differentiation, etc.), and their niche with particular emphasis on their application in regenerative medicine.

Course Component: Lecture

Prerequisites: TMM 3101, (CMM 5001 or (PHS 3341, PHS 3342)).

TMM 4103 Research Methods in Metabolic Diseases (3 units)

Comprehensive exploration of metabolic diseases and acquisition of the skills relevant to research project design (e.g. selection of research models), methodology, and the rigorous interpretation of results. Introduction to approaches for the analysis of large data sets (e.g. from lipidomics, metabolomics), with an emphasis on the skills required for the critical analysis of literature and the development of oral and written communication skills.

Course Component: Lecture

Prerequisite: TMM 3103.

TMM 4104 Systems Biology: Gene Regulatory Networks in Disease (3 units)

Link between disease-associated genes and regulatory networks with emphasis on current techniques in whole genome and transcriptome analysis.

Course Component: Lecture

Prerequisite: TMM 3009.

TMM 4105 Neurological Diseases (3 units)

Exploration of various neurological disorders through a series of lectures and discussion groups. The course will cover the basic clinical presentation and provide an understanding of the pathogenic mechanisms and therapeutic strategies of representative neurological diseases or syndromes.

Course Component: Lecture

Prerequisite: TMM 3106.

TMM 4106 Model Systems of Disease (3 units)

Utilizing model organisms to investigate disease pathogenesis. Fundamental processes/tools and techniques to model diseases in mouse, newt, yeast, zebrafish, c. elegans, and drosophila. Translation of model systems to pathobiology using human resources (e.g. TMA, genome mining, tissue explants, 'omics data, etc.).

Course Component: Lecture

Prerequisite: TMM 3009.

TMM 4107 Viral Pathogenesis (3 units)

Disease oriented basis of human virology, with focus on current medical issues in virus infections.

Course Component: Lecture

Prerequisites: TMM 3101, TMM 3105, TMM 3009.

TMM 4108 Bacterial Diseases (3 units)

Disease oriented basis to human bacterial infections, with focus on current issues such as antibiotic resistance and emerging pathogens, and the microbiome.

Course Component: Lecture

Prerequisites: TMM 3101, TMM 3105, TMM 3009.

TMM 4300 Selected Topics in Biomedical Research (3 units)

Selected topics in current biomedical research.

Course Component: Lecture

Prerequisite: TMM 3009.

TMM 4301 Special Topics in Biochemistry (1.5 units)

Selected topics in biochemistry

Course Component: Lecture

Prerequisite: TMM 3009.

TMM 4302 Special Topics in Epidemiology (1.5 units)

Special Topics in Epidemiology

Course Component: Lecture

Prerequisite: TMM 3009.

TMM 4303 Special Topics in Neuroscience (1.5 units)

Special Topics in Neuroscience

Course Component: Lecture

Prerequisite: TMM 3105.

TMM 4304 Special Topics in Infectious Diseases (1.5 units)

Case based approach to human infectious and inflammatory diseases. Problems will cover a series of diseases depending on current issues in the field.

Course Component: Lecture

Prerequisite: TMM 3105.

TMM 4501 Introduction à la biologie du cancer (3 crédits)

Sujets principaux en biologie du cancer dont les oncogènes et la suppression du cancer, l'apoptose dans le cancer, l'immortalisation et la sénescence des cellules, l'instabilité génomique, les étapes de la tumorigenèse et de l'inflammation dans le cancer, la biologie de l'angiogenèse, les thérapies rationnelles.

Volet : Cours magistral

Préalables : CMM 5001 or (PHS 3341, PHS 3342).

TMM 4504 Biologie des systèmes : Réseaux régulateurs des gènes dans les maladies (3 crédits)

Lien entre les gènes associés à des maladies et les réseaux régulateurs avec emphase sur les techniques modernes pour l'analyse du transcriptome et du génome entier

Volet : Cours magistral

Préalable: TMM 3009.

TMM 4700 Sujets choisis en recherche biomédicale (3 crédits)

Sujets choisis en recherche biomédicale récente.

Volet : Cours magistral

Préalable: TMM 3009.

TMM 4701 Sujets spéciaux en biochimie (1.5 crédits)

Sujets choisis en biochimie

Volet : Cours magistral

Préalable: TMM 3009.

TMM 4910 Méthodes avancées dans la recherche biomédicale - sujets spéciaux / Advanced Methods in Biomedical Research - Special Topics (1.5 crédits / 1.5 units)

Aspects technologiques pertinents à un domaine spécifique de la recherche biomédicale. / Technological aspects relevant to a specific area of biomedical research.

Volet / Course Component: Cours magistral / Lecture

Prerequisite: TMM 3009

TMM 4911 Méthodes avancées dans la recherche biomédicale - biologie cellulaire et microscopie / Advanced Methods in Biomedical Research - Cell Biology and Microscopy (1.5 crédits / 1.5 units)

Formation théorique et pratique sur les techniques modernes de microscopie incluant l'imagerie par fluorescence à une seule ou plusieurs couleurs, la microscopie en champ clair et à fluorescence de cellules vivantes ainsi que l'analyse quantitative d'images. Travaux pratiques avec des microscopes confocaux et à épifluorescence. / Theoretical and practical training in modern microscopy techniques including single and multi-colour fluorescent imaging, live cell fluorescent and bright-field microscopy as well as quantitative image analysis. Practical work with both confocal and epifluorescent microscopes.

Volet / Course Component: Cours magistral / Lecture

rerequisite: TMM 3009.

TMM 4912 Méthodes avancées dans la recherche biomédicale - biochimie et biophysique / Advanced Methods in Biomedical Research - Biochemistry and Biophysics (1.5 crédits / 1.5 units)

Formation théorique et pratique sur plusieurs techniques de pointe pour l'étude des protéines, incluant la cristallographie à rayons X, la calorimétrie à titrage isotherme et la spectroscopie infrarouge. Utilisation de logiciels pour la modélisation, la visualisation et l'analyse structurale de protéines. / Theoretical and practical training in several cutting-edge techniques used to study proteins, including X-ray crystallography, isothermal titration calorimetry and infrared spectroscopy. Utilization of softwares for the modeling, visualization and analysis of protein structure.

Volet / Course Component: Cours magistral / Lecture

Prerequisite: TMM 3009.

TMM 4913 Méthodes avancées dans la recherche biomédicale - acides nucléiques / Advanced Methods in Biomedical Research - Nucleic Acids (1.5 crédits / 1.5 units)

Techniques spécialisées appliquées à l'étude des acides nucléiques, incluant les approches pour l'étude de leurs structures et interactions, de même que leur utilisation potentielle comme agents thérapeutiques. / Specialized techniques applied to the study of nucleic acids, including approaches to study their structure, interactions & their potential use as therapeutic agents.

Volet / Course Component: Cours magistral / Lecture

Prerequisite: TMM 3101.

TMM 4914 Méthodes avancées dans la recherche biomédicale - cytométrie de flux / Advanced Methods in Biomedical Research - Flow Cytometry (1.5 crédits / 1.5 units)

Utilisation de la cytométrie de flux pour l'identification et la quantification de sous-populations de cellules, pour le triage de cellules et pour la mesure de fonction (e.g. cytokine, apoptose et division cellulaire). / Use of flow cytometry for the identification and quantification of cell subpopulations, for cell sorting and for the measurement of function (e.g. cytokine, apoptosis, cell division).

Volet / Course Component: Cours magistral / Lecture

Prerequisite: TMM 3009.

TMM 4915 Méthodes avancées dans la recherche biomédicale - épigénétique et génomique / Advanced Methods in Biomedical Research - Epigenetics and Genomics (1.5 crédits / 1.5 units)

Méthodes avancées utilisées pour l'étude de l'épigénétique et de la génomique, et approches exploratoires transgénomiques. / Advanced methods used for the study of epigenetics and genomics, and genome-wide exploratory approaches.

Volet / Course Component: Cours magistral / Lecture

Prerequisite: TMM 3009.

TMM 4916 Méthodes avancées dans la recherche biomédicale- électrophysiologie / Advanced Methods in Biomedical Research - Electrophysiology (1.5 crédits / 1.5 units)

Principes électriques de base et leur relation avec la mesure du potentiel de la membrane cellulaire et des activités des synapses et des canaux ioniques; régulation par les cellules de leur potentiel membranaire. / Basic electrical principles and how they relate to measurement of cell membrane potential, ion channel and synaptic activities, and how cells regulate membrane potential.

Volet / Course Component: Cours magistral / Lecture

Prerequisite: TMM 3009.

TMM 4917 Méthodes avancées dans la recherche biomédicale - techniques de microbiologie / Advanced Methods in Biomedical Research - Microbiology (1.5 crédits / 1.5 units)

Techniques de base couramment utilisées en recherche microbiologique. / Basic techniques currently used in microbiology research.

Volet / Course Component: Cours magistral / Lecture

Prerequisite: TMM 3009.

TMM 4918 Méthodes avancées dans la recherche biomédicale - protéomique / Advanced Methods in Biomedical Research - Proteomics (1.5 crédits / 1.5 units)

Techniques et méthodologies protéomiques de base pour l'identification des protéines, leur quantification et l'étude de leurs modifications post-traductionelles par spectrométrie de masse à haut-débit. Le format comprendra des cours magistraux, des discussions et des expériences pratiques sur des spectromètres de masse modernes. / Basic proteomic methodologies and approaches covering protein identification, protein quantitation and post-translational analysis by high throughput mass spectrometry based proteomics. Lectures, discussions, and hands-on experiments using state-of-the-art mass spectrometers will be part of the course.

Volet / Course Component: Cours magistral / Lecture

Prerequisite: TMM 3009.

TMM 4950 Communication de la science / Science Communication (3 crédits / 3 units)

Introduction à la communication de la science et au ciblage d'auditoires spécifiques, structure et livraison des présentations orales, conception et rédaction d'articles scientifiques et de textes de vulgarisation, création et présentation d'affiches, communication de la science dans le monde numérique et promotion de soi-même à travers courriels, curriculum vitae, rapports et réseautage. / Introduction to science communication and addressing specific audiences; structure and delivery of oral presentations; design and writing of both scientific papers and general audience pieces; creating and presenting posters; science communication in the digital world and selling oneself through emails, resumes, reports and networking.

Volet / Course Component: Cours magistral / Lecture

Corequisite: TMM 4012.